Typedef Blosum45
BLOSUM45 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecBlosum45> > Blosum45;

Overview

A   5
B  -1  4
C  -1 -2 12
D  -2  5 -3  7
E  -1  1 -3  2  6
F  -2 -3 -2 -4 -3  8
G   0 -1 -3 -1 -2 -3  7
H  -2  0 -3  0  0 -2 -2 10
I  -1 -3 -3 -4 -3  0 -4 -3  5
J  -1 -3 -3 -4 -3  1 -4 -3  4  4
K  -1  0 -3  0  1 -3 -2 -1 -3 -3  5
L  -1 -3 -2 -3 -2  1 -3 -2  2  4 -3  5
M  -1 -2 -2 -3 -2  0 -2  0  2  2 -1  2  6
N  -1  4 -2  2  0 -2  0  1 -2 -3  0 -3 -2  6
O   0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
P  -1 -2 -4 -1  0 -3 -2 -2 -2 -3 -1 -3 -2 -2 -1  9
Q  -1  0 -3  0  2 -4 -2  1 -2 -2  1 -2  0  0 -1 -1  6
R  -2 -1 -3 -1  0 -2 -2  0 -3 -3  3 -2 -1  0 -1 -2  1  7
S   1  0 -1  0  0 -2  0 -1 -2 -3 -1 -3 -2  1  0 -1  0 -1  4
T   0  0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -1  0  0 -1 -1 -1  2  5
U   0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1  0  0 -1
V   0 -3 -1 -3 -3  0 -3 -3  3  2 -2  1  1 -3 -1 -3 -3 -2 -1  0 -1  5
W  -2 -4 -5 -4 -3  1 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -4 -2 -3 -2 -2 -4 -3 -2 -3 15
Y  -2 -2 -3 -2 -2  3 -3  2  0  0 -1  0  0 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -1 -1 -1  3  8
Z  -1  2 -3  1  4 -3 -2  0 -3 -3  1 -2 -1  0 -1 -1  4  0  0 -1 -1 -3 -2 -2  4
X   0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1  0  0 -1 -1 -2 -1 -1 -1
*  -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5  1

    A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  K  L  M  N  O  P  Q  R  S  T  U  V  W  Y  Z  X  *