Typedef Blosum62BLOSUM62 scoring matrix.
BLOSUM62 scoring matrix.
Defined in | <seqan/score.h> |
---|---|
Signature |
typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecBlosum62> > Blosum62;
|
Overview
A 4 B -2 4 C 0 -3 9 D -2 4 -3 6 E -1 1 -4 2 5 F -2 -3 -2 -3 -3 6 G 0 -1 -3 -1 -2 -3 6 H -2 0 -3 -1 0 -1 -2 8 I -1 -3 -1 -3 -3 0 -4 -3 4 J -1 -4 -1 -4 -3 0 -4 -3 3 3 K -1 0 -3 -1 1 -3 -2 -1 -3 -3 5 L -1 -4 -1 -4 -3 0 -4 -3 2 3 -2 4 M -1 -3 -1 -3 -2 0 -3 -2 1 2 -1 2 5 N -2 3 -3 1 0 -3 0 1 -3 -3 0 -3 -2 6 X 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 P -1 -2 -3 -1 -1 -4 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -2 -2 -2 7 Q -1 0 -3 0 2 -3 -2 0 -3 -3 1 -2 0 0 -1 -1 5 R -1 -1 -3 -2 0 -3 -2 0 -3 -3 2 -2 -1 0 -1 -2 1 5 S 1 0 -1 0 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -2 -1 1 0 -1 0 -1 4 T 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -1 0 0 -1 -1 -1 1 5 U 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 0 0 -1 V 0 -3 -1 -3 -2 -1 -3 -3 3 2 -2 1 1 -3 -1 -2 -2 -3 -2 0 -1 4 W -3 -4 -2 -4 -3 1 -2 -2 -3 -3 -3 -2 -1 -4 -2 -4 -2 -3 -3 -2 -2 -3 11 Y -2 -3 -2 -3 -2 3 -3 2 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -1 2 7 Z -1 1 -3 1 4 -3 -2 0 -3 -3 1 -3 -1 0 -1 -1 3 0 0 -1 -1 -2 -3 -2 4 X 0 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -1 -1 -1 * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 1 A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W Y Z X *