Typedef Vtml200VTML200 scoring matrix.
VTML200 scoring matrix.
Defined in | <seqan/score.h> |
---|---|
Signature |
typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecVtml200> > Vtml200;
|
Overview
A 4 B -1 4 C 1 -3 12 D -1 5 -4 6 E -1 2 -4 3 5 F -3 -5 -3 -6 -5 8 G 0 0 -2 -1 -1 -5 8 H -2 1 -2 0 0 0 -2 8 I -1 -4 0 -5 -4 0 -6 -3 5 J -2 -5 -2 -5 -4 1 -6 -3 4 4 K -1 0 -4 0 1 -5 -2 0 -3 -3 5 L -2 -5 -3 -5 -4 2 -5 -2 3 4 -3 5 M -1 -3 -1 -4 -3 1 -4 -3 2 3 -2 3 6 N -1 4 -2 3 1 -4 0 1 -4 -4 1 -4 -3 6 X -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 P 0 -1 -3 -1 -1 -4 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -3 -2 -2 9 Q -1 1 -3 1 2 -3 -2 2 -3 -3 2 -2 -1 1 -1 -1 5 R -2 -1 -3 -2 -1 -4 -2 1 -3 -3 4 -3 -2 0 -1 -1 2 7 S 1 1 1 0 0 -3 0 0 -3 -3 0 -3 -2 1 -1 0 0 -1 4 T 1 0 0 -1 -1 -3 -2 -1 -1 -2 0 -2 -1 0 -1 -1 0 -1 2 4 U -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 V 0 -3 1 -4 -3 -1 -4 -3 4 3 -3 2 2 -3 -1 -3 -2 -3 -2 0 -1 4 W -4 -5 -6 -6 -6 3 -5 -1 -2 -2 -4 -1 -3 -5 -2 -4 -6 -3 -4 -5 -2 -4 15 Y -3 -3 0 -4 -3 5 -5 3 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -1 -5 -3 -2 -2 -3 -1 -2 4 9 Z -1 1 -4 2 4 -4 -2 1 -3 -3 2 -3 -2 1 -1 -1 4 0 0 -1 -1 -3 -6 -3 4 X -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1 A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W Y Z X *