Typedef Blosum80
BLOSUM80 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecBlosum80> > Blosum80;

Overview

A   7
B  -3  6
C  -1 -6 13
D  -3  6 -7 10
E  -2  1 -7  2  8
F  -4 -6 -4 -6 -6 10
G   0 -2 -6 -3 -4 -6  9
H  -3 -1 -7 -2  0 -2 -4 12
I  -3 -6 -2 -7 -6 -1 -7 -6  7
J  -3 -7 -3 -7 -6 -1 -7 -6  5  5
K  -1 -1 -6 -2  1 -5 -3 -1 -5 -5  8
L  -3 -7 -3 -7 -6  0 -7 -5  2  4 -4  6
M  -2 -5 -3 -6 -4  0 -5 -4  2  3 -3  3  9
N  -3  5 -5  2 -1 -6 -1  1 -6 -6  0 -6 -4  9
O  -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2
P  -1 -4 -6 -3 -2 -6 -5 -4 -5 -5 -2 -5 -4 -4 -3 12
Q  -2 -1 -5 -1  3 -5 -4  1 -5 -5  2 -4 -1  0 -2 -3  9
R  -3 -2 -6 -3 -1 -5 -4  0 -5 -5  3 -4 -3 -1 -2 -3  1  9
S   2  0 -2 -1 -1 -4 -1 -2 -4 -4 -1 -4 -3  1 -1 -2 -1 -2  7
T   0 -1 -2 -2 -2 -4 -3 -3 -2 -3 -1 -3 -1  0 -1 -3 -1 -2  2  8
U  -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -1 -1 -2
V  -1 -6 -2 -6 -4 -2 -6 -5  4  3 -4  1  1 -5 -2 -4 -4 -4 -3  0 -2  7
W  -5 -8 -5 -8 -6  0 -6 -4 -5 -5 -6 -4 -3 -7 -5 -7 -4 -5 -6 -5 -5 -5 16
Y  -4 -5 -5 -6 -5  4 -6  3 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -3 -6 -3 -4 -3 -3 -3 -3  3 11
Z  -2  0 -7  1  6 -6 -4  0 -6 -6  1 -5 -3 -1 -1 -2  5  0 -1 -2 -1 -4 -5 -4  6
X  -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -5 -3 -1 -2
*  -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8  1

    A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  K  L  M  N  O  P  Q  R  S  T  U  V  W  Y  Z  X  *