Typedef Blosum80BLOSUM80 scoring matrix.
BLOSUM80 scoring matrix.
Defined in | <seqan/score.h> |
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Signature |
typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecBlosum80> > Blosum80;
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Overview
A 7 B -3 6 C -1 -6 13 D -3 6 -7 10 E -2 1 -7 2 8 F -4 -6 -4 -6 -6 10 G 0 -2 -6 -3 -4 -6 9 H -3 -1 -7 -2 0 -2 -4 12 I -3 -6 -2 -7 -6 -1 -7 -6 7 J -3 -7 -3 -7 -6 -1 -7 -6 5 5 K -1 -1 -6 -2 1 -5 -3 -1 -5 -5 8 L -3 -7 -3 -7 -6 0 -7 -5 2 4 -4 6 M -2 -5 -3 -6 -4 0 -5 -4 2 3 -3 3 9 N -3 5 -5 2 -1 -6 -1 1 -6 -6 0 -6 -4 9 O -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 P -1 -4 -6 -3 -2 -6 -5 -4 -5 -5 -2 -5 -4 -4 -3 12 Q -2 -1 -5 -1 3 -5 -4 1 -5 -5 2 -4 -1 0 -2 -3 9 R -3 -2 -6 -3 -1 -5 -4 0 -5 -5 3 -4 -3 -1 -2 -3 1 9 S 2 0 -2 -1 -1 -4 -1 -2 -4 -4 -1 -4 -3 1 -1 -2 -1 -2 7 T 0 -1 -2 -2 -2 -4 -3 -3 -2 -3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -1 -2 2 8 U -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -1 -1 -2 V -1 -6 -2 -6 -4 -2 -6 -5 4 3 -4 1 1 -5 -2 -4 -4 -4 -3 0 -2 7 W -5 -8 -5 -8 -6 0 -6 -4 -5 -5 -6 -4 -3 -7 -5 -7 -4 -5 -6 -5 -5 -5 16 Y -4 -5 -5 -6 -5 4 -6 3 -3 -3 -4 -2 -3 -4 -3 -6 -3 -4 -3 -3 -3 -3 3 11 Z -2 0 -7 1 6 -6 -4 0 -6 -6 1 -5 -3 -1 -1 -2 5 0 -1 -2 -1 -4 -5 -4 6 X -1 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -5 -3 -1 -2 * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 1 A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W Y Z X *