SeqAn3  3.0.3
The Modern C++ library for sequence analysis.

alignment → configuration Relation

File in seqan3/alignmentIncludes file in seqan3/alignment/configuration
all.hppall.hpp
pairwise / detail / policy_affine_gap_recursion.hppalign_config_gap_cost_affine.hpp
pairwise / detail / policy_scoring_scheme.hppalign_config_scoring_scheme.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_result_type.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_band.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_debug.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_method.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_on_result.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_output.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_parallel.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_score_type.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_scoring_scheme.hpp
pairwise / detail / type_traits.hppalign_config_vectorised.hpp
scoring / detail / simd_match_mismatch_scoring_scheme.hppalign_config_method.hpp
scoring / detail / simd_matrix_scoring_scheme.hppalign_config_method.hpp
matrix / detail / alignment_score_matrix_one_column_banded.hppalign_config_band.hpp
matrix / detail / alignment_trace_matrix_full_banded.hppalign_config_band.hpp
pairwise / align_result_selector.hppalign_config_debug.hpp
pairwise / alignment_algorithm.hppalign_config_band.hpp
pairwise / alignment_algorithm.hppalign_config_scoring_scheme.hpp
pairwise / alignment_configurator.hppalign_config_output.hpp
pairwise / alignment_configurator.hppalign_config_result_type.hpp
pairwise / edit_distance_algorithm.hppalign_config_edit.hpp
pairwise / edit_distance_fwd.hppalign_config_min_score.hpp
pairwise / policy / affine_gap_init_policy.hppalign_config_method.hpp
pairwise / policy / affine_gap_policy.hppalign_config_gap_cost_affine.hpp
pairwise / policy / alignment_matrix_policy.hppalign_config_band.hpp
pairwise / policy / find_optimum_policy.hppalign_config_method.hpp
pairwise / policy / simd_affine_gap_policy.hppalign_config_gap_cost_affine.hpp