This is the complete list of members for seqan3::alignment_file_output< selected_field_ids_, valid_formats_, ref_ids_type >, including all inherited members.

begin() noexcept	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
const_iterator typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
const_reference typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
difference_type typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
emplace_back(arg_t &&arg, arg_types &&... args) requires(!is_default_selected_field_ids)	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
end() noexcept	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
field_ids typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
header()	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
is_default_selected_field_ids	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	static
iterator typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
operator=(sam_file_output const &)=delete	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
operator=(sam_file_output &&)=default	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
operator=(rng_t &&range)	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
options	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
push_back(record_t &&r)	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
push_back(tuple_t &&t)	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
reference typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
sam_file_output()=delete	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
sam_file_output(sam_file_output const &)=delete	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
sam_file_output(sam_file_output &&)=default	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
sam_file_output(std::filesystem::path filename, selected_field_ids const &fields_tag=selected_field_ids{})	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
sam_file_output(stream_type &stream, file_format const &format_tag, selected_field_ids const &fields_tag=selected_field_ids{})	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
sam_file_output(stream_type &&stream, file_format const &format_tag, selected_field_ids const &fields_tag=selected_field_ids{})	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
sam_file_output(std::filesystem::path const &filename, ref_ids_type_ &&ref_ids, ref_lengths_type &&ref_lengths, selected_field_ids const &fields_tag=selected_field_ids{})	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
sam_file_output(stream_type &&stream, ref_ids_type_ &&ref_ids, ref_lengths_type &&ref_lengths, file_format const &format_tag, selected_field_ids const &fields_tag=selected_field_ids{})	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	inline
sam_file_output(std::filesystem::path, selected_field_ids const &) -> sam_file_output< selected_field_ids, typename sam_file_output<>::valid_formats, ref_info_not_given >	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &&, file_format const &, selected_field_ids const &) -> sam_file_output< selected_field_ids, type_list< file_format >, ref_info_not_given >	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &, file_format const &, selected_field_ids const &) -> sam_file_output< selected_field_ids, type_list< file_format >, ref_info_not_given >	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &&, file_format const &) -> sam_file_output< typename sam_file_output<>::selected_field_ids, type_list< file_format >, ref_info_not_given >	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &, file_format const &) -> sam_file_output< typename sam_file_output<>::selected_field_ids, type_list< file_format >, ref_info_not_given >	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(std::filesystem::path const &, ref_info_not_given &&, ref_lengths_type &&, selected_field_ids const &) -> sam_file_output< selected_field_ids, typename sam_file_output<>::valid_formats, std::remove_reference_t< ref_info_not_given >>	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(std::filesystem::path const &, ref_info_not_given &&, ref_lengths_type &&) -> sam_file_output< typename sam_file_output<>::selected_field_ids, typename sam_file_output<>::valid_formats, std::remove_reference_t< ref_info_not_given >>	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &&, ref_info_not_given &&, ref_lengths_type &&, file_format const &, selected_field_ids const &) -> sam_file_output< selected_field_ids, type_list< file_format >, std::remove_reference_t< ref_info_not_given >>	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &, ref_info_not_given &&, ref_lengths_type &&, file_format const &, selected_field_ids const &) -> sam_file_output< selected_field_ids, type_list< file_format >, std::remove_reference_t< ref_info_not_given >>	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &&, ref_info_not_given &&, ref_lengths_type &&, file_format const &) -> sam_file_output< typename sam_file_output<>::selected_field_ids, type_list< file_format >, std::remove_reference_t< ref_info_not_given >>	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
sam_file_output(stream_type &, ref_info_not_given &&, ref_lengths_type &&, file_format const &) -> sam_file_output< typename sam_file_output<>::selected_field_ids, type_list< file_format >, std::remove_reference_t< ref_info_not_given >>	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >	related
selected_field_ids typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
sentinel typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
size_type typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
stream_char_type typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
valid_formats typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
value_type typedef	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >
~sam_file_output()=default	seqan3::sam_file_output< fields< field::seq, field::id, field::offset, field::ref_id, field::ref_offset, field::alignment, field::cigar, field::mapq, field::qual, field::flag, field::mate, field::tags, field::header_ptr >, type_list< format_sam, format_bam >, ref_info_not_given >