Typedef Blosum45
BLOSUM45 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecBlosum45> > Blosum45;

Overview

A      5
R     -2   7
N     -1   0   6
D     -2  -1   2   7
C     -1  -3  -2  -3  12
Q     -1   1   0   0  -3   6
E     -1   0   0   2  -3   2   6
G      0  -2   0  -1  -3  -2  -2   7
H     -2   0   1   0  -3   1   0  -2  10
I     -1  -3  -2  -4  -3  -2  -3  -4  -3   5
L     -1  -2  -3  -3  -2  -2  -2  -3  -2   2   5
K     -1   3   0   0  -3   1   1  -2  -1  -3  -3   5
M     -1  -1  -2  -3  -2   0  -2  -2   0   2   2  -1   6
F     -2  -2  -2  -4  -2  -4  -3  -3  -2   0   1  -3   0   8
P     -1  -2  -2  -1  -4  -1   0  -2  -2  -2  -3  -1  -2  -3   9
S      1  -1   1   0  -1   0   0   0  -1  -2  -3  -1  -2  -2  -1   4
T      0  -1   0  -1  -1  -1  -1  -2  -2  -1  -1  -1  -1  -1  -1   2   5
W     -2  -2  -4  -4  -5  -2  -3  -2  -3  -2  -2  -2  -2   1  -3  -4  -3  15
Y     -2  -1  -2  -2  -3  -1  -2  -3   2   0   0  -1   0   3  -3  -2  -1   3   8
V      0  -2  -3  -3  -1  -3  -3  -3  -3   3   1  -2   1   0  -3  -1   0  -3  -1   5
B     -1  -1   4   5  -2   0   1  -1   0  -3  -3   0  -2  -3  -2   0   0  -4  -2  -3   4
Z     -1   0   0   1  -3   4   4  -2   0  -3  -2   1  -1  -3  -1   0  -1  -2  -2  -3   2   4
X      0  -1  -1  -1  -2  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1   0   0  -2  -1  -1  -1  -1  -1
*     -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5  -5   1

+      A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V   B   Z   X   *