Typedef Blosum62
BLOSUM62 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecBlosum62> > Blosum62;

Overview

A      4
R     -1   5
N     -2   0   6
D     -2  -2   1   6
C      0  -3  -3  -3   9
Q     -1   1   0   0  -3   5
E     -1   0   0   2  -4   2   5
G      0  -2   0  -1  -3  -2  -2   6
H     -2   0   1  -1  -3   0   0  -2   8
I     -1  -3  -3  -3  -1  -3  -3  -4  -3   4
L     -1  -2  -3  -4  -1  -2  -3  -4  -3   2   4
K     -1   2   0  -1  -3   1   1  -2  -1  -3  -2   5
M     -1  -1  -2  -3  -1   0  -2  -3  -2   1   2  -1   5
F     -2  -3  -3  -3  -2  -3  -3  -3  -1   0   0  -3   0   6
P     -1  -2  -2  -1  -3  -1  -1  -2  -2  -3  -3  -1  -2  -4   7
S      1  -1   1   0  -1   0   0   0  -1  -2  -2   0  -1  -2  -1   4
T      0  -1   0  -1  -1  -1  -1  -2  -2  -1  -1  -1  -1  -2  -1   1   5
W     -3  -3  -4  -4  -2  -2  -3  -2  -2  -3  -2  -3  -1   1  -4  -3  -2  11
Y     -2  -2  -2  -3  -2  -1  -2  -3   2  -1  -1  -2  -1   3  -3  -2  -2   2   7
V      0  -3  -3  -3  -1  -2  -2  -3  -3   3   1  -2   1  -1  -2  -2   0  -3  -1   4
B     -2  -1   3   4  -3   0   1  -1   0  -3  -4   0  -3  -3  -2   0  -1  -4  -3  -3   4
Z     -1   0   0   1  -3   3   4  -2   0  -3  -3   1  -1  -3  -1   0  -1  -3  -2  -2   1   4
X      0  -1  -1  -1  -2  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -2   0   0  -2  -1  -1  -1  -1  -1
*     -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4   1

+      A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V   B   Z   X   *