Typedef Vtml200VTML200 scoring matrix.
VTML200 scoring matrix.
Defined in | <seqan/score.h> |
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Signature |
typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecVtml200> > Vtml200;
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Overview
A 4 R -2 7 N -1 0 6 D -1 -2 3 6 C 1 -3 -2 -4 12 Q -1 2 1 1 -3 5 E -1 -1 1 3 -4 2 5 G 0 -2 0 -1 -2 -2 -1 8 H -2 1 1 0 -2 2 0 -2 8 I -1 -3 -4 -5 0 -3 -4 -6 -3 5 L -2 -3 -4 -5 -3 -2 -4 -5 -2 3 5 K -1 4 1 0 -4 2 1 -2 0 -3 -3 5 M -1 -2 -3 -4 -1 -1 -3 -4 -3 2 3 -2 6 F -3 -4 -4 -6 -3 -3 -5 -5 0 0 2 -5 1 8 P 0 -1 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -4 -3 -1 -3 -4 9 S 1 -1 1 0 1 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 0 4 T 1 -1 0 -1 0 0 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1 -3 -1 2 4 W -4 -3 -5 -6 -6 -6 -6 -5 -1 -2 -1 -4 -3 3 -4 -4 -5 15 Y -3 -2 -2 -4 0 -3 -3 -5 3 -2 -1 -3 -2 5 -5 -2 -3 4 9 V 0 -3 -3 -4 1 -2 -3 -4 -3 4 2 -3 2 -1 -3 -2 0 -4 -2 4 B -1 -1 4 5 -3 1 2 0 1 -4 -5 0 -3 -5 -1 1 0 -5 -3 -3 4 Z -1 0 1 2 -4 4 4 -2 1 -3 -3 2 -2 -4 -1 0 -1 -6 -3 -3 1 4 X -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 1 + A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *