Typedef Vtml200
VTML200 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecVtml200> > Vtml200;

Overview

A      4
R     -2    7
N     -1    0    6
D     -1   -2    3    6
C      1   -3   -2   -4   12
Q     -1    2    1    1   -3    5
E     -1   -1    1    3   -4    2    5
G      0   -2    0   -1   -2   -2   -1    8
H     -2    1    1    0   -2    2    0   -2    8
I     -1   -3   -4   -5    0   -3   -4   -6   -3    5
L     -2   -3   -4   -5   -3   -2   -4   -5   -2    3    5
K     -1    4    1    0   -4    2    1   -2    0   -3   -3    5
M     -1   -2   -3   -4   -1   -1   -3   -4   -3    2    3   -2    6
F     -3   -4   -4   -6   -3   -3   -5   -5    0    0    2   -5    1    8
P      0   -1   -2   -1   -3   -1   -1   -2   -2   -4   -3   -1   -3   -4    9
S      1   -1    1    0    1    0    0    0    0   -3   -3    0   -2   -3    0    4
T      1   -1    0   -1    0    0   -1   -2   -1   -1   -2    0   -1   -3   -1    2    4
W     -4   -3   -5   -6   -6   -6   -6   -5   -1   -2   -1   -4   -3    3   -4   -4   -5   15
Y     -3   -2   -2   -4    0   -3   -3   -5    3   -2   -1   -3   -2    5   -5   -2   -3    4    9
V      0   -3   -3   -4    1   -2   -3   -4   -3    4    2   -3    2   -1   -3   -2    0   -4   -2    4
B     -1   -1    4    5   -3    1    2    0    1   -4   -5    0   -3   -5   -1    1    0   -5   -3   -3    4
Z     -1    0    1    2   -4    4    4   -2    1   -3   -3    2   -2   -4   -1    0   -1   -6   -3   -3    1    4
X     -1   -1   -1   -2   -1   -1   -1   -2    0   -1   -1   -1   -1   -1   -2   -1   -1   -2   -1   -1   -1   -1   -1
*     -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6   -6    1

+      A    R    N    D    C    Q    E    G    H    I    L    K    M    F    P    S    T    W    Y    V    B    Z    X    *