Typedef Pam200
PAM200 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecPam200> > Pam200;

Overview

A   3
B   0  3
C  -3 -5 12
D   0  4 -6  5
E   0  3 -7  4  5
F  -4 -6 -6 -7 -7 10
G   1  0 -4  0  0 -6  6
H  -2  1 -4  0  0 -2 -3  8
I  -1 -3 -3 -3 -3  1 -3 -3  6
J  -2 -4 -5 -4 -4  2 -4 -3  4  5
K  -2  0 -7  0  0 -7 -2 -1 -2 -3  6
L  -2 -4 -7 -5 -4  2 -5 -3  2  5 -4  7
M  -2 -3 -6 -4 -3  0 -4 -3  2  3  1  4  8
N   0  3 -5  3  2 -4  0  2 -2 -3  1 -4 -2  3
O   0 -1 -4 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -2 -1 -2 -1  0 -1
P   1 -1 -4 -2 -1 -6 -1 -1 -3 -3 -2 -3 -3 -1 -1  7
Q  -1  1 -7  2  3 -6 -2  3 -3 -3  1 -2 -1  1 -1  0  5
R  -2 -1 -4 -2 -2 -5 -4  2 -2 -3  4 -4 -1  0 -1  0  1  7
S   1  1  0  0  0 -4  1 -1 -2 -3  0 -4 -2  1  0  1 -1 -1  2
T   1  0 -3  0 -1 -4  0 -2  0 -1  0 -2 -1  0  0  0 -1 -1  2  4
U   0 -1 -4 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -2 -1 -2 -1  0 -1 -1 -1 -1  0  0 -1
V   0 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -3  4  3 -3  2  2 -2 -1 -2 -3 -3 -1  0 -1  5
W  -7 -6 -9 -8 -9  0 -8 -3 -6 -4 -4 -2 -5 -5 -5 -7 -6  2 -3 -6 -5 -8 18
Y  -4 -4  0 -5 -5  7 -6  0 -2 -2 -5 -2 -3 -2 -3 -6 -5 -5 -3 -3 -3 -3 -1 11
Z   0  2 -7  3  4 -6 -1  2 -3 -3  0 -3 -2  1 -1 -1  4  0 -1 -1 -1 -2 -7 -5  4
X   0 -1 -4 -1 -1 -3 -1 -1 -1 -2 -1 -2 -1  0 -1 -1 -1 -1  0  0 -1 -1 -5 -3 -1 -1
*  -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9 -9  1

    A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  K  L  M  N  O  P  Q  R  S  T  U  V  W  Y  Z  X  *