Typedef Vtml200
VTML200 scoring matrix.

Defined in <seqan/score.h>
Signature typedef Score<int, ScoreMatrix<AminoAcid, ScoreSpecVtml200> > Vtml200;

Overview

A   4
B  -1  4
C   1 -3 12
D  -1  5 -4  6
E  -1  2 -4  3  5
F  -3 -5 -3 -6 -5  8
G   0  0 -2 -1 -1 -5  8
H  -2  1 -2  0  0  0 -2  8
I  -1 -4  0 -5 -4  0 -6 -3  5
J  -2 -5 -2 -5 -4  1 -6 -3  4  4
K  -1  0 -4  0  1 -5 -2  0 -3 -3  5
L  -2 -5 -3 -5 -4  2 -5 -2  3  4 -3  5
M  -1 -3 -1 -4 -3  1 -4 -3  2  3 -2  3  6
N  -1  4 -2  3  1 -4  0  1 -4 -4  1 -4 -3  6
X  -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2  0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
P   0 -1 -3 -1 -1 -4 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -3 -2 -2  9
Q  -1  1 -3  1  2 -3 -2  2 -3 -3  2 -2 -1  1 -1 -1  5
R  -2 -1 -3 -2 -1 -4 -2  1 -3 -3  4 -3 -2  0 -1 -1  2  7
S   1  1  1  0  0 -3  0  0 -3 -3  0 -3 -2  1 -1  0  0 -1  4
T   1  0  0 -1 -1 -3 -2 -1 -1 -2  0 -2 -1  0 -1 -1  0 -1  2  4
U  -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2  0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1
V   0 -3  1 -4 -3 -1 -4 -3  4  3 -3  2  2 -3 -1 -3 -2 -3 -2  0 -1  4
W  -4 -5 -6 -6 -6  3 -5 -1 -2 -2 -4 -1 -3 -5 -2 -4 -6 -3 -4 -5 -2 -4 15
Y  -3 -3  0 -4 -3  5 -5  3 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -1 -5 -3 -2 -2 -3 -1 -2  4  9
Z  -1  1 -4  2  4 -4 -2  1 -3 -3  2 -3 -2  1 -1 -1  4  0  0 -1 -1 -3 -6 -3  4
X  -1 -1 -1 -2 -1 -1 -2  0 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1
*  -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6  1

    A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  K  L  M  N  O  P  Q  R  S  T  U  V  W  Y  Z  X  *