alphabet/aminoacid/concept.hpp

Go to the documentation of this file.

// SPDX-FileCopyrightText: 2006-2024 Knut Reinert & Freie Universität Berlin
// SPDX-FileCopyrightText: 2016-2024 Knut Reinert & MPI für molekulare Genetik
// SPDX-License-Identifier: BSD-3-Clause
 
#pragma once
 
#include <type_traits>
 
#include <seqan3/alphabet/concept.hpp>
#include <seqan3/core/detail/template_inspection.hpp>
 
// ============================================================================
// aminoacid_empty_base
// ============================================================================
 
namespace seqan3
{
 
struct aminoacid_empty_base
{};
 
} // namespace seqan3
 
// ============================================================================
// enable_aminoacid
// ============================================================================
 
namespace seqan3::detail::adl_only
{
 
template <typename... args_t>
void enable_aminoacid(args_t...) = delete;
 
template <typename alphabet_t>
struct enable_aminoacid_cpo : public detail::customisation_point_object<enable_aminoacid_cpo<alphabet_t>, 2>
{
    using base_t = detail::customisation_point_object<enable_aminoacid_cpo<alphabet_t>, 2>;
    using base_t::base_t;
 
    template <typename alphabet_type>
    using alphabet_or_type_identity =
        std::conditional_t<std::is_nothrow_default_constructible_v<std::remove_cvref_t<alphabet_type>>
                               && seqan3::is_constexpr_default_constructible_v<std::remove_cvref_t<alphabet_type>>,
                           std::remove_cvref_t<alphabet_type>,
                           std::type_identity<alphabet_type>>;
 
    template <typename alphabet_type = alphabet_t>
    static constexpr auto SEQAN3_CPO_OVERLOAD(priority_tag<2>)(
        /*return*/ std::bool_constant<seqan3::custom::alphabet<alphabet_type>::enable_aminoacid>::value == true /*;*/
    );
 
    template <typename alphabet_type = alphabet_t>
    static constexpr auto SEQAN3_CPO_OVERLOAD(priority_tag<1>)(
        /*return*/ std::bool_constant<enable_aminoacid(alphabet_or_type_identity<alphabet_type>{})>::value == true /*;*/
    );
 
    template <typename alphabet_type = alphabet_t>
    static constexpr auto SEQAN3_CPO_OVERLOAD(priority_tag<0>)(
        /*return*/ std::is_base_of_v<seqan3::aminoacid_empty_base, alphabet_type> == true /*;*/
    );
};
 
} // namespace seqan3::detail::adl_only
 
namespace seqan3
{
 
template <typename t>
inline constexpr bool enable_aminoacid =
    detail::adl_only::enable_aminoacid_cpo<std::remove_cvref_t<t>>::cpo_overload(detail::priority_tag<2>{});
 
// ============================================================================
// concept
// ============================================================================
 
template <typename type>
concept aminoacid_alphabet = alphabet<type> && enable_aminoacid<type>;
 
} // namespace seqan3