Here is a list of all documented variables with links to the class documentation for each member:

- o -

• offset_char : seqan3::phred42, seqan3::phred63, seqan3::phred68solexa, seqan3::phred94
• offset_phred : seqan3::phred42, seqan3::phred63, seqan3::phred68solexa, seqan3::phred94
• only_coordinates : seqan3::detail::alignment_configurator::select_matrix_policy< traits_t >
• only_max_error_total : seqan3::detail::policy_max_error, seqan3::detail::search_traits< search_configuration_t >
• open_score : seqan3::align_cfg::gap_cost_affine
• optimal_column : seqan3::detail::score_matrix_single_column< score_t >
• optimal_coordinate : seqan3::detail::policy_optimum_tracker< alignment_configuration_t, optimum_updater_t >, seqan3::detail::policy_optimum_tracker_simd< alignment_configuration_t, optimum_updater_t >
• optimal_score : seqan3::detail::policy_optimum_tracker< alignment_configuration_t, optimum_updater_t >, seqan3::detail::policy_optimum_tracker_simd< alignment_configuration_t, optimum_updater_t >
• optimum : seqan3::detail::alignment_algorithm_state< score_type >
• option_calls : seqan3::detail::format_parse
• options : seqan3::sam_file_input< traits_type_, selected_field_ids_, valid_formats_ >, seqan3::sam_file_output< selected_field_ids_, valid_formats_, ref_ids_type >, seqan3::sequence_file_input< traits_type_, selected_field_ids_, valid_formats_ >, seqan3::sequence_file_output< selected_field_ids_, valid_formats_ >, seqan3::structure_file_input< traits_type_, selected_field_ids_, valid_formats_ >, seqan3::structure_file_output< selected_field_ids_, valid_formats_ >
• other_alignment : seqan3::aligned_allocator< value_t, alignment_v >::rebind< new_value_type >
• output_index_cursor : seqan3::detail::search_traits< search_configuration_t >
• output_query_id : seqan3::detail::search_traits< search_configuration_t >
• output_reference_begin_position : seqan3::detail::search_traits< search_configuration_t >
• output_reference_id : seqan3::detail::search_traits< search_configuration_t >
• output_requires_locate_call : seqan3::detail::search_traits< search_configuration_t >
• output_sequence1_id : seqan3::detail::alignment_configuration_traits< configuration_t >
• output_sequence2_id : seqan3::detail::alignment_configuration_traits< configuration_t >
• overflow_buffer : seqan3::detail::fast_istreambuf_iterator< char_t, traits_t >